Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Otol1Q4ZJM7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Otol1Q4ZJM7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Otol1Q4ZJM7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms