Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc27Q3V036 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc27Q3V036 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc27Q3V036 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms