Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc190Q3URK1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc190Q3URK1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc190Q3URK1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc190Q3URK1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc190Q3URK1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc190Q3URK1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms