Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nkain3Q3URJ8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nkain3Q3URJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nkain3Q3URJ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms