Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrch2Q3UMG5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrch2Q3UMG5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch2Q3UMG5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms