Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rmdn3Q3UJU9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rmdn3Q3UJU9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rmdn3Q3UJU9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms