Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc34Q3UI66 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc34Q3UI66 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc34Q3UI66 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc34Q3UI66 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms