Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
XylbQ3TNA1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
XylbQ3TNA1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
XylbQ3TNA1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms