Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim43aQ3TL54 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim43aQ3TL54 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms