Protein–RNA interactions for Protein: Q149F3

Gspt2, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3B, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gspt2Q149F3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gspt2Q149F3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gspt2Q149F3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gspt2Q149F3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gspt2Q149F3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms