Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zc3h18Q0P678 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zc3h18Q0P678 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms