Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Crisp3Q03402 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Crisp3Q03402 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms