Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cbx1P83917 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cbx1P83917 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cbx1P83917 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cbx1P83917 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms