Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubg1P83887 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubg1P83887 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms