Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2d2P62838 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2d2P62838 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms