Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PlnP61014 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PlnP61014 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PlnP61014 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PlnP61014 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PlnP61014 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PlnP61014 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PlnP61014 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PlnP61014 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PlnP61014 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PlnP61014 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PlnP61014 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.3 ms