Protein–RNA interactions for Protein: P59279

Rab2b, Ras-related protein Rab-2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2bP59279 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab2bP59279 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rab2bP59279 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rab2bP59279 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms