Protein–RNA interactions for Protein: P53201

SWC4, SWR1-complex protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWC4P53201 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 DAL3YIR032C 588 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 PGU1YJR153W 1086 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 DAL82YNL314W 768 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 PIN2YOR104W 849 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 SCT1YBL011W 2280 nt5.49□□□□□ -1.53
SWC4P53201 DUG1YFR044C 1446 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 TFC6YDR362C 2019 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 HSP104YLL026W 2727 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 NUD1YOR373W 2556 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 PTK2YJR059W 2457 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 AMA1YGR225W 1782 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 ARP2YDL029W 1176 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 YNL165WYNL165W 1221 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 HST2YPL015C 1074 nt5.48□□□□□ -1.53
SWC4P53201 SMF2YHR050W 1650 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 CLB2YPR119W 1476 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 YAP1801YHR161C 1914 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 TFS1YLR178C 660 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 CPA1YOR303W 1236 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 VPS5YOR069W 2028 nt5.47□□□□□ -1.53
SWC4P53201 YIR007WYIR007W 2295 nt5.46□□□□□ -1.53
SWC4P53201 PYC1YGL062W 3537 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YDL057WYDL057W 987 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 COX26YDR119W-A 201 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YLR194CYLR194C 765 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 MKK2YPL140C 1521 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 TEL2YGR099W 2067 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.46□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YEH1YLL012W 1722 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 STE13YOR219C 2796 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 BUL1YMR275C 2931 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 MID1YNL291C 1647 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 CRZ1YNL027W 2037 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 RTT106YNL206C 1368 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 ALD6YPL061W 1503 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 FHN1YGR131W 525 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 PGA3YML125C 939 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 VTH1YIL173W 4650 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 VTH2YJL222W 4650 nt5.45□□□□□ -1.54
SWC4P53201 TRK2YKR050W 2670 nt5.44□□□□□ -1.54
SWC4P53201 CAD1YDR423C 1230 nt5.44□□□□□ -1.54
SWC4P53201 MLC1YGL106W 450 nt5.44□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YJR115WYJR115W 510 nt5.44□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YFL042CYFL042C 2025 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 OXP1YKL215C 3861 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YDL034WYDL034W 345 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 RPL7AYGL076C 735 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YLL059CYLL059C 507 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YLR296WYLR296W 327 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 GFD1YMR255W 567 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 CAR1YPL111W 1002 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 RPL7BYPL198W 735 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YGL036WYGL036W 2730 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 STL1YDR536W 1710 nt5.43□□□□□ -1.54
SWC4P53201 ATP1YBL099W 1638 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 IRS4YKR019C 1848 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 CDC11YJR076C 1248 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 MSN2YMR037C 2115 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 SHE10YGL228W 1734 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 UGO1YDR470C 1509 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 ACC1YNR016C 6702 nt5.42□□□□□ -1.54
SWC4P53201 TEA1YOR337W 2280 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 JIP4YDR475C 2631 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 KNH1YDL049C 807 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YFL064CYFL064C 525 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 COS9YKL219W 1224 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 MRPL13YKR006C 795 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YLR118CYLR118C 684 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 RPS15YOL040C 429 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 YPR202WYPR202W 717 nt5.41□□□□□ -1.54
SWC4P53201 TIM54YJL054W 1437 nt5.4□□□□□ -1.55
SWC4P53201 ALT1YLR089C 1779 nt5.39□□□□□ -1.55
SWC4P53201 IDP1YDL066W 1287 nt5.39□□□□□ -1.55
SWC4P53201 OST3YOR085W 1053 nt5.39□□□□□ -1.55
SWC4P53201 QDR3YBR043C 2070 nt5.39□□□□□ -1.55
SWC4P53201 PAP2YOL115W 1755 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 YGR182CYGR182C 354 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 RBD2YPL246C 789 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 GEX1YCL073C 1848 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 GEX2YKR106W 1848 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 VPS70YJR126C 2436 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 TEF1YPR080W 1377 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 TEF2YBR118W 1377 nt5.38□□□□□ -1.55
SWC4P53201 YMR155WYMR155W 1644 nt5.37□□□□□ -1.55
SWC4P53201 SOG2YOR353C 2376 nt5.37□□□□□ -1.55
SWC4P53201 OPT1YJL212C 2400 nt5.37□□□□□ -1.55
SWC4P53201 DBP9YLR276C 1785 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42 ms