Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fgd1P52734 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fgd1P52734 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgd1P52734 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fgd1P52734 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms