Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl9P51670 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl9P51670 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl9P51670 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms