Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa8P50706 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa8P50706 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa8P50706 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa8P50706 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Defa8P50706 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms