Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pdcd2P46718 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pdcd2P46718 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pdcd2P46718 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcd2P46718 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms