Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NsfP46460 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NsfP46460 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NsfP46460 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NsfP46460 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsfP46460 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsfP46460 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsfP46460 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsfP46460 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NsfP46460 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NsfP46460 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NsfP46460 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsfP46460 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsfP46460 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NsfP46460 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NsfP46460 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NsfP46460 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsfP46460 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NsfP46460 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NsfP46460 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NsfP46460 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NsfP46460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsfP46460 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsfP46460 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NsfP46460 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NsfP46460 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NsfP46460 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms