Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rpl28P41105 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
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