Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rasgrf1P27671 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rasgrf1P27671 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rasgrf1P27671 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171 ms