Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itgb7P26011 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itgb7P26011 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Itgb7P26011 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb7P26011 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms