Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt13P08730 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt13P08730 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt13P08730 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms