Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01793 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01793 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01793 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01793 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01793 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01793 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01793 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01793 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01793 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01793 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01793 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01793 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01793 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01793 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01793 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01793 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01793 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01793 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01793 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01793 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01793 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01793 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01793 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01793 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01793 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01793 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms