Protein–RNA interactions for Protein: P00416

mt-Co3, Cytochrome c oxidase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
mt-Co3P00416 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
mt-Co3P00416 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
mt-Co3P00416 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
mt-Co3P00416 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
mt-Co3P00416 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms