Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtco1P00397 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Mtco1P00397 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mtco1P00397 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms