Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ShdO88834 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ShdO88834 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms