Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ShdO88834 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ShdO88834 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ShdO88834 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ShdO88834 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ShdO88834 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ShdO88834 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ShdO88834 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ShdO88834 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ShdO88834 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ShdO88834 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ShdO88834 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ShdO88834 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms