Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dnmt3aO88508 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dnmt3aO88508 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dnmt3aO88508 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms