Protein–RNA interactions for Protein: O88447

Klc1, Kinesin light chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc1O88447 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Klc1O88447 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Klc1O88447 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Klc1O88447 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc1O88447 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Klc1O88447 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Klc1O88447 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Klc1O88447 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Klc1O88447 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klc1O88447 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc1O88447 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc1O88447 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klc1O88447 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Klc1O88447 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc1O88447 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc1O88447 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc1O88447 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms