Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-ObO35424 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-ObO35424 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-ObO35424 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-ObO35424 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-ObO35424 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-ObO35424 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms