Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp2O08999 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ltbp2O08999 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ltbp2O08999 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ltbp2O08999 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ltbp2O08999 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.8 ms