Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5294J3QP53 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5294J3QP53 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5294J3QP53 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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