Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28051J3QMA2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm28051J3QMA2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28051J3QMA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.6 ms