Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930544D05RikJ3QK56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
4930544D05RikJ3QK56 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930544D05RikJ3QK56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms