Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hmgxb3G3X9M3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hmgxb3G3X9M3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hmgxb3G3X9M3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms