Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm17430F6RSK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm17430F6RSK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm17430F6RSK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms