Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2610021A01RikE9Q0Q3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
2610021A01RikE9Q0Q3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
2610021A01RikE9Q0Q3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms