Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc183A2AJB1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc183A2AJB1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc183A2AJB1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc183A2AJB1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms