Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ino80eA0A0U1RP99 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms