Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib1Q9Z0F4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib1Q9Z0F4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib1Q9Z0F4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib1Q9Z0F4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cib1Q9Z0F4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cib1Q9Z0F4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cib1Q9Z0F4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cib1Q9Z0F4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms