Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AireQ9Z0E3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
AireQ9Z0E3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AireQ9Z0E3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms