Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nufip1Q9QXX8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nufip1Q9QXX8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nufip1Q9QXX8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms