Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cml5Q9QXS8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cml5Q9QXS8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cml5Q9QXS8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.1 ms