Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bace2Q9JL18 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bace2Q9JL18 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Bace2Q9JL18 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Bace2Q9JL18 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms