Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpa33Q9JKA5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpa33Q9JKA5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms