Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cldn19Q9ET38 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cldn19Q9ET38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cldn19Q9ET38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms